devtools::install_github("artitzco/itz")
devtools::install_github("artitzco/fraping")Vamos a comenzar
En la paquetería fraping se implementan las funciones necesarias para realizar el análisis de datos de FRAP. Sin embargo, para que esta funcione correctamente, también es necesario instalar la paquetería itz. Ambos son repositorios de GitHub, y su instalación se lleva a cabo mediante la función install_github de la paquetería devtools de R.
De esta forma, las librerías quedarán instaladas en su equipo, por lo que cada que inicie un nuevo proyecto para el análisis de datos de FRAP, únicamente tendrá que importar las librerías correspondientes:
library(itz)
library(fraping)Comienza Ahora (opcional)
Si deseas comenzar a utilizar la librería fraping de inmediato, puedes descargar un conjunto de datos de ejemplo utilizando la función downloadData. Esta función descargará un archivo con datos de FRAP en la carpeta “data” dentro de tu directorio de trabajo, que puedes utilizar como punto de partida para practicar los métodos de análisis que se describen en este manual. Ten en cuenta que esta descarga es opcional y puedes utilizar tus propios datos de FRAP si los tienes disponibles.
Si deseas utilizar los datos de ejemplo, ejecuta el siguiente código en la consola de comandos de R: fraping::downloadData(). Después de ejecutar esta función, además de la carpeta “data”, encontrarás un script de prueba llamado “test.fraping.R” en la raíz del directorio. Puedes utilizar este script como punto de partida para explorar y analizar los datos de FRAP.
La función newDataFrap crea una base para un nuevo grupo de datos de FRAP, la función sintetiza la información y devuelve una lista que permite al usuario manipular sus datos con mayor facilidad. Los parámetros que admite son el nombre del grupo y la intensidad del fotoblanqueo en porcentaje. Para más detalles ir a newDataFrap.
Para evitar futuros problemas, el nombre del grupo debe cumplir con las siguientes recomendaciones:
- No debe incluir espacios,
- Debe inicial con una letra,
- Sólo se admiten los caracteres especiales “.” y “_”.
A <- newDataFrap("Neurites", 80)
B <- newDataFrap("Secondary.Neurites", 80)
C <- newDataFrap("Dendrites", 80)Recuerda seguir estas recomendaciones al crear nuevos grupos de datos de FRAP. Esto asegurará la consistencia y la correcta manipulación de los datos en futuros análisis.